Évaluation plus approfondie de la formation et de la toxicité des efflorescences de cyanobactéries à l'aide de génomes assemblés par métagénome du microbiome de lac

Période de financement : 2024-2029
Responsable : Sophie Crevecoeur
Financement total de l'IRDG : 173 762 $

Le lac Érié est confronté à des proliférations d'algues nuisibles constituées de cyanobactéries (PANc) qui menacent la santé des écosystèmes, mais les méthodes de détection actuelles ne permettent pas de déterminer si ces proliférations sont potentiellement toxiques ni ce qui les déclenchent au-delà des charges en éléments nutritifs, qui sont de mauvais prédicteurs. Le séquençage en aveugle permet la reconstruction des génomes assemblés par métagénome (GAM) qui relient la diversité microbienne (cyanobactéries et microbiome associé) à ses fonctions (production de toxines et cycle des éléments nutritifs). En plus d'offrir un nouvel angle pour étudier les causes des PAN (facteurs biotiques), la mise au point de nouvelles techniques de séquençage portables peut transformer cette approche novatrice en outil de détection rapide et précoce sur place de la toxicité des proliférations.