Puces transcriptomiques ciblées (EcoToxChips) pour caractériser les voies de toxicité moléculaire et les points de départ transcriptomiques (tPOD) de mélanges chez les poissons indigènes

Période de financement : 2024-2029
Responsable : Gerald Tetreault
Financement total de l'IRDG : 164 396 $

Les évaluations des risques traditionnelles reposent sur les essais réalisés sur des animaux ou la collecte de poissons sauvages afin de déterminer la toxicité des contaminants. Le « test de toxicité pour les embryons de poissons (FET) utilisant des plaques de culture de tissus » porte sur les stades sensibles du développement des poissons (développement embryonnaire et éclosion) (OCDE, 2013). Ce test repose sur une procédure de renouvellement statique et tire profit de la conception des plaques qui permet d'économiser de l'espace. Cela permet une répétition suffisante avec un nombre approprié d'œufs par répétition pour assurer la robustesse statistique. Le test fournit des renseignements essentiels sur les effets chez une espèce expérimentale canadienne pertinente. Il couvre les stades sensibles du développement et évalue des critères d'effet pertinents sur le plan environnemental (survie embryonnaire, éclosion, longueur à l'éclosion et difformités à l'éclosion) qui peuvent être utilisés dans les évaluations des risques environnementaux. Une nouvelle méthode consiste à combiner le test FET avec de nouvelles approches de toxicologie moléculaire qui sont en cours d'élaboration et qui commencent à contribuer grandement à la compréhension de l'impact des contaminants sur le biote aquatique. Cependant, le lien entre les réponses « omiques » et les effets apicaux plus généraux retarde souvent d'adoption de ces nouvelles approches. Un essai transcriptomique réduit (EcoToxChip) développé récemment sera utilisé pour tester les effets de mélanges complexes de contaminants mesurés dans une matrice des programmes SWAPIT-PIMPC sur l'expression de gènes pertinents à l'aide de l'EcoToxChip de la tête-de-boule et de la truite arc-en-ciel. Plus précisément, l'EcoToxChip sera exécutée pour déterminer si la toxicogénomique peut être utilisée comme une approche de surveillance fondée sur les effets pour les poissons exposés à des contaminants ou à des facteurs de stress abiotiques (c.-à-d. mélanges et facteurs de stress cumulatifs).